Diferença entre VNTR e STR

Diferença de chave - VNTR vs STR
 

Os estudos de DNA têm imensa utilidade na compreensão e determinação das relações filogenéticas, no diagnóstico de doenças genéticas e no mapeamento dos genomas do organismo. Várias técnicas associadas à análise de DNA são usadas para a identificação de um gene em particular ou uma sequência de DNA em um conjunto de DNA desconhecido. Eles são conhecidos como marcadores genéticos. Marcadores genéticos são usados ​​na biologia molecular para identificar variações genéticas entre indivíduos e espécies. A repetição em tandem de número variável (VNTR) e a repetição em tandem curta (STR) são dois tipos de marcadores genéticos que mostram polimorfismo entre os indivíduos. Ambos os tipos são DNA repetitivo não codificador que são repetições em tandem. Eles são organizados de forma a seguir os cromossomos. VNTR é uma seção do genoma em que a sequência curta de nucleotídeos é repetida várias vezes. STR é outra seção do DNA dentro do genoma, que é organizada como unidades repetidas, consistindo de dois a treze nucleotídeos em cem vezes. A principal diferença entre VNTR e STR é o número de nucleotídeos em uma sequência repetida. As unidades repetidas de VNTR consistem em 10 a 100 nucleotídeos enquanto a unidade repetida de STR consiste em 2 a 13 nucleotídeos. VNTR e STR são amplamente utilizados em estudos forenses.

CONTEÚDO

1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é VNTR 
3. O que é STR
4. Semelhanças entre VNTR e STR
5. Comparação lado a lado - VNTR vs STR em forma de tabela
6. Resumo

O que é VNTR?

Uma repetição em tandem é uma sequência curta de DNA que é repetida da maneira cabeça a cauda em um locus cromossômico específico. Não há outra sequência ou nucleotídeo na repetição em tandem. Existem vários tipos de repetições em tandem no genoma. O VNTR é um tipo de repetição em tandem entre eles, que possui unidades repetidas que consistem em 10 a 100 nucleotídeos. VNTR é um tipo de minissatélite. Essas repetições em tandem podem ser encontradas em muitos cromossomos. Eles são intercalados no genoma humano e estão situados predominantemente nas regiões subteloméricas dos cromossomos.

 Os VNTRs mostram polimorfismo repetido em tandem entre os indivíduos. O comprimento do VNTR em um local específico do cromossomo é altamente variável entre os indivíduos devido à variação no número de unidades de repetição organizadas nessa seção de DNA. Portanto, o VNTR pode ser usado como uma ferramenta poderosa na identificação de indivíduos e a análise do VNTR é utilizada em muitos campos, incluindo genética, pesquisa em biologia, análise forense e impressão digital de DNA. Os VNTRs foram os primeiros marcadores genéticos usados ​​para quantificar o enxerto de transplante de medula óssea. Os VNTRs também foram os primeiros marcadores polimórficos usados ​​no perfil de DNA em análises forenses.

Figura 01: Variação dos VNTRs em seis indivíduos

A análise de VNTR é realizada via polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição seguido por hibridação de Southern. Portanto, ele precisa comparativamente de uma grande amostra de DNA. A interpretação do perfil VNTR também é problemática. Devido a essas limitações, o uso de VNTR na genética forense foi limitado e é substituído pela análise STR.

O que é STR?

STR é uma seção de DNA altamente repetitiva que consiste em duas a treze unidades de repetição de nucleotídeos organizadas de maneira tandem. STR é semelhante ao VNTR. Mas isso varia de VNTR a partir do número de nucleotídeos em uma sequência de repetição e o número de repetições. STR é um tipo de microssatélite.

Análise STR envolvida na medição do número exato de unidades repetidas. Os STRs são altamente variáveis ​​entre os indivíduos, semelhantes aos VNTs. Os perfis STR diferem de pessoa para pessoa. Portanto, a análise STR é usada na biologia molecular para comparar loci específicos no DNA de duas ou mais amostras. Portanto, os STRs são considerados marcadores genéticos poderosos em biologia molecular. Ele fornece uma excelente ferramenta para identificação de indivíduos devido ao seu alto grau de polimorfismo e comprimento relativamente curto.

Atualmente, os STRs são a ferramenta de polimorfismo genético analisado mais comumente usada na genética forense. A maioria dos casos forenses envolve análise polimórfica de STR. Os loci STR estão espalhados por todo o genoma. Existem milhares de STRs localizados em cromossomos que podem ser usados ​​em análises forenses. A análise STR não envolve polimorfismo de comprimento de restrição como a análise VNTR. A análise STR não corta o DNA com enzimas de restrição. Sondas específicas são usadas para conectar regiões desejadas ao DNA e, usando a técnica de PCR, os comprimentos do STR são determinados.

Figura 02: Variação STR entre amostras

Quais são as semelhanças entre VNTR e STR?

• VNTR e STR são DNA não codificante.
• Ambos são repetições em tandem.
• Ambos mostram polimorfismo entre os indivíduos devido à diferença no comprimento da seção de DNA.
• Ambos são usados ​​como marcadores genéticos poderosos na impressão digital de DNA e em estudos forenses.

Qual é a diferença entre VNTR e STR?

VNTR vs STR
O VNTR é um DNA repetitivo não codificante que possui uma sequência nucleotídica curta repetida de maneira tandem.	STR é uma seção de DNA altamente repetitiva que consiste em duas a treze unidades de repetição de nucleotídeos organizadas de maneira tandem.
Tamanho
VNTRs são maiores que STRs.	STRs são menores que VNTRs.
Número de nucleotídeos na sequência de repetição
A unidade de repetição do VNTR consiste em 10 a 100 nucleotídeos.	A unidade repetida de STR consiste em 2 a 13 nucleotídeos.

Resumo - VNTR vs STR

VNTR e STR são dois marcadores genéticos poderosos usados ​​em biologia molecular, especialmente no campo da genética forense. VNTR é um tipo de minisatélite e STR é um microssatélite. VNTR e STR são DNA altamente codificador e altamente repetitivo. São repetições em tandem. A estrutura geral do VNTR e STR é a mesma. No entanto, o número de nucleotídeos na sequência de repetição e o comprimento são diferentes. O VNTR possui sequências repetidas consistindo em 10 a 100 nucleotídeos. STR possui sequências repetidas que consistem em 2 a 13 nucleotídeos. Esta é a diferença entre VNTR e STR.

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Referências:

1. "A ciência da genética forense". CRG - Conselho de Genética Responsável. N.p., n.d. Rede. Disponivel aqui. 10 de julho de 2017.
2. "Análise STR". Wikipedia. Fundação Wikimedia, 22 de março de 2017. Web. Disponivel aqui. 10 de julho de 2017.

Cortesia da imagem:

1. “D1S80Demo” Por PaleWhaleGail na Wikipedia em inglês (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia