o diferença chave entre VNTR e sonda é que VNTR é uma sequência curta de nucleotídeos que ocorre como uma repetição em tandem no genoma, enquanto uma sonda é uma sequência curta de DNA ou RNA sintetizada artificialmente que pode ser marcada radioativamente.
VNTR significa número variável de repetição em tandem. É uma sequência nucleotídica curta organizada em repetições em tandem no genoma. Os VNTRs ocorrem naturalmente em nosso genoma. Uma sonda é uma sequência curta de DNA ou RNA sintetizada artificialmente. Tanto a sonda quanto o VNTR são ácidos nucleicos ou sequências nucleotídicas curtas. Eles têm imenso uso em diferentes técnicas biológicas moleculares, principalmente em estudos forenses. O VNTR e o probe compartilham algumas semelhanças e diferenças. Portanto, o artigo tenta destacar a diferença entre VNTR e probe.
1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é um VNTR
3. O que é uma sonda
4. Semelhanças entre o VNTR e o probe
5. Comparação lado a lado - VNTR vs Sonda em forma de tabela
6. Resumo
VNTR é uma sequência nucleotídica curta que existe como uma repetição em tandem em nosso genoma. Os VNTRs estão presentes em muitos cromossomos. Além disso, os VNTRs diferem entre diferentes indivíduos dos comprimentos, já que o número de repetições é diferente nos VNTRs de diferentes pessoas. Basicamente, é devido a alelos herdados de seus pais. Portanto, usamos principalmente VNTRs para identificação dos pais (herança) ou para fins pessoais. Da mesma forma, também é possível usá-los em genética, forense, pesquisa biológica e impressão digital de DNA. Portanto, o VNTR é uma ferramenta importante em biologia molecular.
Figura 01: VNTR
Na herança, analisamos os dados do VNTR usando dois princípios básicos: correspondência de herança e correspondência de identidade. Durante a correspondência de herança, o indivíduo deve ter um alelo correspondente ao de cada pai. Durante a correspondência de identidade, ambos os alelos VNTR devem estar presentes em um local específico do genoma.
No contexto da biologia molecular, uma sonda é um fragmento de DNA ou RNA sintetizado artificialmente com um comprimento de 100 a 1000 bases. Podemos rotular radioativamente essas sondas. Portanto, nós os usamos na detecção de seqüências de nucleotídeos alvo que são complementares à sequência da sonda. Quando adicionamos sondas à amostra, a hibridação ocorre com as sequências complementares ou sequências alvo e facilita a identificação das sequências alvo. Como as sondas possuem radioatividade, podemos detectá-las facilmente.
Figura 02: Sonda
Na ciência forense, comumente usamos sondas em técnicas de criação de perfil de DNA, como a detecção de regiões repetidas em tandem curtas, polimorfismos de comprimento de fragmentos de restrição e impressões digitais de DNA.
VNTR é uma região do genoma organizada como repetições em tandem, enquanto uma sonda é uma sequência curta de DNA ou RNA sintetizada artificialmente para detectar sequências alvo em uma amostra. Portanto, essa é a principal diferença entre o VNTR e o probe. Além disso, uma diferença importante entre o VNTR e a sonda é que, diferentemente dos VNTRs, podemos rotular radioativamente as sondas.
Além disso, os VNTRs realizam identificações parentais, enquanto as sondas ajudam a detectar sequências nucleotídicas alvo em amostras de DNA ou RNA que são complementares à sequência da sonda. Portanto, essa também é uma diferença significativa entre o VNTR e a sonda.
O infográfico a seguir apresenta mais informações sobre a diferença entre VNTR e sonda.
O uso comum de VNTR e sonda é em técnicas de análise molecular, como estudos forenses e impressões digitais de DNA. Ambos consistem em comprimentos variáveis. No entanto, a principal diferença entre VNTR e sonda é que um VNTR é uma região do genoma arranjado com repetições em tandem, enquanto uma sonda é um fragmento de DNA ou RNA que pode ser marcado radioativamente. Além disso, os VNTRs estão presentes no genoma. Mas, as sondas são sintetizadas artificialmente e podem ser marcadas radioativamente para detectar sequências nucleotídicas alvo em amostras de DNA ou RNA que são complementares à sequência na sonda. Portanto, este é o resumo da diferença entre VNTR e probe.
1. “Número variável de repetições em tandem (VNTR) e sua aplicação na epidemiologia bacteriana.” Alerta científico: Journal, Disponível aqui.
2. "Sonda de DNA". Notícias da natureza, Nature Publishing Group, disponível aqui.
1. “D1S80Demo” Por PaleWhaleGail na Wikipedia em inglês (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. “Faróis Moleculares” (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia