Diferença entre shRNA e siRNA

shRNA vs siRNA

Durante o processo de interferência do RNA (RNAi), a expressão de um gene alvo é derrubada com alta especificidade e seletividade. O RNAi é um processo natural e envolve pequeno RNA interferente (siRNA) e RNA hairpin curto (shRNA) e shRNA bi-funcional. Atualmente, o RNAi é amplamente utilizado como uma ferramenta para terapia personalizada contra o câncer. As aplicações do RNAi são basicamente feitas com o siRNA de cadeia dupla sintetizado quimicamente e as moléculas de shRNA baseadas em vetores. Embora essas duas moléculas tenham resultados funcionais semelhantes, elas diferem em sua estrutura; assim, os mecanismos moleculares de ação, as vias de RNA e os efeitos fora do alvo dessas duas moléculas também diferem.

shRNA

O shRNA é uma sequência de pequena molécula de RNA que faz uma curva fechada que pode ser usada para silenciar a expressão de um gene alvo durante o RNAi. A expressão do shRNA é alcançada por um vetor, que pode ser um vírus ou uma bactéria ou por entrega de plasmídeos. Eles são sintetizados no núcleo das células e transportado para o citoplasma para outros processos. Essas moléculas têm vias de maturação semelhantes ao miRNA; assim a síntese de miRNA forneceu as bases para a compreensão da síntese de shRNA. Quer ARN polimerase II ou III pode transcrever shRNA através de RNA polimerase II ou III promotores. A vantagem do uso de shRNAs é que eles têm relativamente baixa taxa de degradação e rotatividade. A desvantagem é que ele precisa de um vetor de expressão, o que pode causar alguns problemas de segurança.

siRNA

siRNAs são moléculas de cadeia dupla de RNA compostos de 20- 25 pares de bases de comprimento. Estes são usados ​​para a supressão de genes pelo silenciamento do gene com qualquer sequência de nucleotídeos complementar em RNAi via. Gene knockdown por transfecção de siRNA é muitas vezes mal sucedida devido a efeito transitório; especialmente em células que se dividem rapidamente e a supressão não dura mais. Para superar esse problema, o siRNA é modificado através da introdução de uma estrutura curta em gancho de cabelo. Essa molécula modificada é conhecida como shRNA. shRNA deve ser convertido para ARNsi por um Dicer, a fim de proceder sua função normal.

Qual é a diferença entre shRNA e siRNA?

• Diferente do siRNA, o shRNA possui uma estrutura extra em gancho de cabelo. shRNA é uma versão modificada do siRNA.

• shRNA requer um vetor de expressão, enquanto o siRNA não.

• shRNA pode ser usado para knockdown a longo prazo, enquanto o siRNA pode ser usado apenas para knockdown a curto prazo de genes.

• Ao contrário da supressão genética do siRNA, a supressão do shRNA é duradoura e, se for inserida por um vetor viral apropriado, pode produzir efeitos permanentes de silenciamento genético.

• Dicer é necessário para converter parte de trás shRNA a molécula de siRNA para executar suas funções normais.