Diferença entre RNASE A e RNASE H

Diferença de chave - RNASE A vs RNASE H
 

As ribonucleases são nucleases que degradam especificamente o RNA em unidades menores. Eles podem ser divididos em duas categorias; endoribonucleases e exoribonucleases. A endoribonuclease é uma endonuclease que pode degradar o RNA de fita simples ou dupla. Cliva as ligações fosfodiéster dentro de uma cadeia polinucleotídica de RNA. Os exemplos são RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P e RNase H. A exoribonuclease é uma exonuclease que degradou o RNA removendo nucleotídeos terminais da extremidade 5 'ou da extremidade 3' da molécula de RNA. Os exemplos são RNase R, RNase II, RNase D e RNase PH. o diferença chave entre RNASE A e RNASE H é que o A RNase A é uma ribonuclease pancreática que degrada especificamente o RNA de fita simples em componentes menores, enquanto a RNase H é uma enzima inespecífica que cliva o RNA no híbrido RNA-DNA em unidades menores através do mecanismo hidrolítico.

CONTEÚDO

1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é RNASE A
3. O que é o RNASE H
4. Semelhanças entre RNASE A e RNASE H
5. Comparação lado a lado - RNASE A vs RNASE H em forma de tabela
6. Resumo

O que é RNASE A?

A RNase A é uma ribonuclease pancreática que cliva especificamente os resíduos de citosina e uracil não emparelhados na extremidade 3 'do RNA de fita simples. A RNase H trabalha em uma concentração mais alta de sal (concentração de NaCl 0,3M ou superior). A reação hidrolítica é realizada em duas etapas. Ele forma um produto fosforilado em 3 'via intermediário monofosfato cíclico 2', 3 '. Embora seja específico para o RNA de fita simples em uma concentração mais alta de sal, ele também pode degradar o RNA e o RNA de fita dupla no híbrido RNA-DNA na concentração mais baixa de NaCl (menor que 0,3M NaCl).

Bruce Merrifield primeiro sintetizou esta enzima. A RNase A é uma enzima muito popular na pesquisa molecular. A RNase pancreática bovina é um exemplo da RNase A. E é uma das enzimas mais difíceis usadas em laboratório. Esta enzima não precisa de um cofator para sua atividade. É uma enzima altamente termoestável. A RNase A é a primeira enzima e a terceira proteína à qual foi detectada uma sequência correta de aminoácidos. Esta enzima é muito pequena, com 124 aminoácidos e massa molecular de 12600da. E possui quatro resíduos de histidina (His 12 e His 119, que envolvem reação catalítica).

Figura 01: A RNase A

A RNase A pode ser isolada fervendo uma amostra bruta. Quando ferve, todas as outras enzimas degradam a RNase A. restante. A RNase A é uma enzima incrivelmente estável. Esta enzima inibe com complexos inibidores da proteína inibidora de ribonuclease, metais pesados ​​e vanadato de uridina.

O que é RNase H?

A RNase H é uma enzima inespecífica de ribonuclease que pode degradar o RNA no híbrido RNA-DNA via reação hidrolítica. A RNase H cliva a ligação 3'- a O-P do RNA em um híbrido RNA-DNA. Por fim, produz produtos com 3'OH e 5 'com fosfato. Na replicação do DNA, ele desempenha um papel fundamental ao remover o RNA primer após a formação de novas fitas de DNA. Em condições de laboratório, degrada especificamente o RNA no RNA-DNA híbrido, mas não no DNA e no RNA não-hibridizado. E essa enzima é geralmente usada para destruir o modelo de RNA após a formação da primeira fita de DNA complementar durante a síntese de cDNA.

Figura 02: RNase H

A RNase H também utiliza em ensaios de proteção de nucleases. Também pode ser incorporado à remoção da cauda poli A do mRNA. A RNase H tem a capacidade de destruir o RNA não codificador dentro e fora da célula. Os íons metálicos são necessários como cofatores para esta atividade proteica. Um quelante (EDTA) pode ser usado para inibir a enzima RNase H.

Quais são as semelhanças entre RNASE A e RNASE H?

• Ambos são de natureza proteica.
• Ambos são endoribonuclease
• Ambos podem degradar o RNA.
• Ambos realizam reações hidrolíticas.
• Os laboratórios moleculares usam esses dois.

Qual é a diferença entre RNASE A e RNASE H?

RNASE H vs RNASE A
A RNase A é uma ribonuclease pancreática que cliva especificamente a extremidade 3 'de resíduos de citosina e uracil não pareados do RNA de fita simples a uma concentração mais alta de sal.	A RNase H é uma enzima inespecífica da ribonuclease que pode degradar o RNA no híbrido RNA-DNA via reação hidrolítica.
Natureza da clivagem de RNA
A RNase A cliva especificamente o RNA de fita simples em maior concentração de sal.	RNase H cliva RNA no híbrido RNA-DNA.
Necessidade de co-fatores para a atividade
A RNase A não precisa de cofatores para sua atividade.	A RNase H precisa de íons metálicos como cofatores para sua atividade.
Inibidores da atividade proteica
Proteína inibidora de ribonuclease, complexos de vanadato de metal pesado e uridina inibe a atividade da RNAse A.	Um quelante (EDTA) inibe a atividade da RNase H.
Remoção do RNA Primer na replicação do DNA
A RNase A não é usada para remoção do RNA primer na replicação do DNA.	RNase H é usado para remoção de RNA primer na replicação do DNA
Remoção de modelos de DNA na síntese de DNA complementar (C-DNA)
A RNase A não é usada para remoção do modelo de RNA durante a síntese complementar de DNA (C-DNA).	A RNase H é usada para remoção do modelo de RNA durante a síntese complementar de DNA (C-DNA).
Remoção de Poly-A-Tail em mRNA hibridado em Oligo (dt)
A RNase A não é usada para remover a "cauda poli-A" no mRNA hibridado com oligo (dt).	A RNase H é usada para remover a "cauda poli-A" no mRNA hibridado com oligo (dt)

Sumário - RNASE H vs RNASE A

As ribonucleases são enzimas nuclease que têm a capacidade de clivar o RNA em unidades menores. Eles são dois tipos; endoribonucleases e exoribonucleases. A endoribonuclease é uma endonuclease que tem a capacidade de degradar o RNA de fita simples ou dupla. E quebra a ligação fosfodiéster dentro de uma cadeia polinucleotídica de RNA. RNase A e RNase H são duas endoribonucleases. A RNase A é uma ribonuclease pancreática que cliva especificamente resíduos de citosina e uracil não emparelhados na extremidade 3 'do RNA de fita simples em maior concentração de sal. A RNase H é uma enzima inespecífica da ribonuclease que pode degradar o RNA no híbrido RNA-DNA via reação hidrolítica. Esta é a diferença entre a RNase A e a RNase H.

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Referência:

1.Karuturi, Autor Amrutha. “17 precisam conhecer fatos sobre a RNase A.” Blog da AG, 22 de fevereiro de 2017. Disponível aqui
2. "Ribonuclease". Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5 de janeiro de 2018. Disponível aqui  

Cortesia da imagem:

1.'RNase A'By Nenhum autor legível por máquina é fornecido. Vossman assumiu (com base em reivindicações de direitos autorais)., (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia
2.'RNase H fix'By Nenhum autor legível por máquina fornecido. Vossman assumiu (com base em reivindicações de direitos autorais)., (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia