Diferença entre proteômica direcionada e não segmentada

A principal diferença entre proteômica direcionada e não direcionada é que o a proteômica direcionada visa medir a abundância de uma proteína específica, enquanto a proteômica não direcionada não tem como alvo uma proteína específica.

Proteômica é o estudo em larga escala de proteínas, suas estruturas e funções. Estuda todo o complemento de proteína em uma célula, tecido ou organismo em condições específicas. Existem dois tipos de proteômica como proteômica direcionada e proteômica não direcionada.

CONTEÚDO

1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é proteômica direcionada
3. O que é proteômica não direcionada
4. Semelhanças entre proteômica direcionada e não direcionada
5. Comparação lado a lado - Proteômica direcionada versus não direcionada em forma de tabela
6. Resumo

O que é proteômica direcionada?

Como o próprio nome indica, a proteômica direcionada tem como alvo uma proteína específica ou um peptídeo em uma mistura complexa de proteínas para análise. Em seguida, analisa a presença e a quantidade dessa proteína específica pré-selecionada. Este método é possível para apenas uma amostra ou entre várias amostras. Este método é adequado mesmo para um grupo específico de proteínas. Isso resulta em dados mais precisos, quantitativos e sensíveis. Além disso, a espectrometria de massa juntamente com proteômica direcionada produz medições confiáveis ​​mais precisas. Este método utiliza o espectrômetro de massa triplo quadrupolo (QQQ) para sua análise.

Figura 01: Proteômica

A proteômica direcionada é um método adequado se você deseja verificar se um objetivo de knockdown é realmente derrubado ou quando deseja quantificar uma proteína / peptídeo específico no soro sanguíneo, no fluido cerebral ou no lisado celular etc. Você também pode usá-lo se desejar para verificar se uma proteína específica é diferencialmente expressa em amostras ou durante um experimento ao longo do tempo.

O que é proteômica não direcionada?

A proteômica não segmentada, como o nome menciona, não tem como alvo uma proteína ou peptídeo específico para sua análise. Proteômica de descoberta é outro nome para proteômica não segmentada. De fato, é uma análise mais 'global'. Geralmente, executar proteômica não direcionada é responder à pergunta “que proteína ou proteínas estão nesta amostra ou em várias amostras?”. Este método não é sensível como proteômica direcionada. Mas ele pode identificar e medir muitas proteínas, incluindo novas proteínas. A proteômica não direcionada pode produzir medições quantitativas e qualitativas.

Quais são as semelhanças entre proteômica direcionada e não segmentada?

• A proteômica direcionada e não direcionada mede proteínas em amostras.
• Eles são importantes na análise de proteoma.
• Esses métodos usam espectrometria de massa.

Qual é a diferença entre proteômica direcionada e não segmentada?

Em primeiro lugar, proteômica direcionada é a determinação da presença e quantidade de uma proteína ou peptídeo específico em uma mistura complexa de proteínas. Por outro lado, a proteômica não direcionada é o estudo quantitativo e qualitativo das proteínas presentes em uma amostra ou amostras sem atingir uma proteína específica. A proteômica direcionada é realizada com proteínas pré-selecionadas ou direcionadas, enquanto a proteômica não direcionada é realizada para descobrir os tipos de proteínas nesta amostra. Além disso, a proteômica direcionada é mais sensível que a proteômica não direcionada.

Resumo - Proteômica Segmentada vs Não Segmentada

Em resumo, proteômica direcionada e não direcionada são dois tipos de estudos de proteínas. Como seus nomes sugerem, a proteômica direcionada tem como alvo uma proteína específica, enquanto a proteômica não direcionada não tem como alvo uma proteína específica. Essa é a diferença entre proteômica direcionada e não segmentada.

Referência:

1. "Proteômica direcionada". UC Davis Proteomics Core, disponível aqui.
2. "Proteômica / Introdução à Proteômica". Teoria / Modos de Música - Wikilivros, livros abertos por um mundo aberto, disponíveis aqui.

Cortesia da imagem:

1. "Proteomics" Por Xxl7441 em Inglês Wikibooks - Transferido de en.wikibooks para Commons (Domínio Público) via Commons Wikimedia