Diferença entre proteômica e transcriptômica

Diferença chave - Proteômica vs Transcriptomics
 

A tecnologia omic é uma tendência atual, em que as diferentes biomoléculas de um organismo são consideradas como uma coleção inteira no que diz respeito às suas propriedades e funções. A tecnologia omic possui uma ampla variedade de aplicações. Os diferentes omics de uma amostra biológica incluem genômica, proteômica, transcriptômica e metabolômica. A proteômica envolve o estudo completo de todas as proteínas em um organismo vivo. É definido como o conjunto de todas as proteínas expressas em um organismo, suas propriedades estruturais e funcionais. O conjunto completo de proteínas, portanto, forma o proteoma. Transcriptômica é o estudo completo de todas as moléculas de RNA mensageiro (mRNA) presentes em um organismo vivo. Assim, a transcriptômica lida com os genes que são expressos ativamente em um organismo vivo. O conjunto total de RNAm em um organismo vivo é referido como transcriptoma. o diferença chave entre Proteômica e Transcriptômica é baseada no tipo de biomolécula. Na proteômica, o conjunto total de proteínas expressas em um organismo vivo é estudado, enquanto na transcriptômica o mRNA total de um organismo vivo é estudado..

CONTEÚDO

1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é proteômica
3. O que é Transcriptômica
4. Semelhanças entre proteômica e transcriptômica
5. Comparação lado a lado - proteômica versus transcriptômica em forma de tabela
6. Resumo

O que é proteômica?

O termo proteômica foi cunhado no ano de 1995 e foi inicialmente definido como o complemento total de proteínas em uma célula, tecido ou organismo. Com o avanço dos estudos proteômicos, foi então modificado para ser considerado um termo genérico no qual muitos campos de estudo foram incluídos. Atualmente, sob o tema proteômica, são estudadas a estrutura, orientação, funções, suas interações, modificações, aplicações e importância das proteínas. Portanto, muitas pesquisas são conduzidas no campo da proteômica atualmente.

Os primeiros estudos proteômicos foram realizados para identificar o conteúdo de proteínas em Escherichia coli. O mapeamento do conteúdo total de proteínas foi realizado com géis bidimensionais (2D). Com o sucesso disso, os cientistas passaram a caracterizar o conteúdo total de proteínas em animais, como cobaias e camundongos. Atualmente, o mapeamento de proteínas humanas é feito usando eletroforese em gel 2D.

Aplicações de Proteômica

Existem muitas vantagens no estudo da proteômica, pois as proteínas são as moléculas que governam a maior parte da atividade devido à propriedade catalisadora das proteínas. Assim, o estudo de proteínas inteiras pode fornecer informações sobre o estado de saúde de um organismo. Algumas aplicações são;

1. Anotação do genoma: Ao estudar o conteúdo de proteínas de um organismo, os genomas exatos responsáveis ​​pelo composto proteico ativo podem ser determinados. Neste cenário, os resultados de toda a genômica, transcriptômica e proteômica são importantes.
2. Identificação / diagnóstico de doenças: A proteômica é usada na identificação da condição da doença, comparando os saudáveis ​​e os doentes
3. Para realizar expressão proteica estudado durante a experimentação.
4. Modificações de proteínas e estudos de interação: Para usar proteínas em vitro condições ou e na Vivo condições, decidir as condições de armazenamento dessas proteínas extraídas e estudar o comportamento da proteína em em vitro, na Vivo métodos in-silico.

Figura 01: Proteômica

Existem diferentes técnicas envolvidas em proteômica

1. Extração da proteína total e separação das proteínas por eletroforese em gel 2D. As proteínas também podem ser separadas usando Cromatografia Líquida de Alto Desempenho (HPLC).
2. Sequenciamento das proteínas extraídas usando métodos como o método de sequenciamento de Edmund ou espectrometria de massa.
3. Uma vez identificadas as seqüências, as propriedades estruturais e funcionais do conteúdo de proteínas são analisadas usando software de computador e ferramentas de bioinformática.

O que é Transcriptômica?

O termo transcriptoma é cunhado recentemente. A Transcriptômica é o estudo do conteúdo total de mRNA de um organismo. O mRNA total é o DNA expresso em um organismo ou célula viva. A coleção completa de mRNA é referida como transcriptoma.

Os passos para analisar o transcriptoma incluem,

1. Extração de RNA, separação de RNAm por cromatografia em coluna de gel com esferas de poli DT.
2. O seqüenciamento do mRNA é feito.

A tecnologia de microarrays é uma maneira comum de identificar o transcriptoma de um organismo. A técnica de microarray envolve uma placa de sonda com os fios complementares do transcriptoma. Após a hibridação, o mRNA presente no organismo ou células pode ser caracterizado.

Figura 02: Técnicas transcriptômicas

A transcriptômica agora é amplamente utilizada na área médica. O diagnóstico de doenças e o perfil de doenças são os principais campos em que a Transcriptômica é usada. Ao analisar um transcriptoma de um organismo, o mRNA estrangeiro pode ser identificado e, se houver alguma infecção, ele pode ser identificado. O RNA não codificador pode ser separado usando tecnologias transcriptômicas. E também a expressão de genes sob diferentes estresses ambientais pode ser monitorada.

 Quais são as semelhanças entre proteômica e transcriptômica?

• Ambos fazem parte do conceito de tecnologia ômica.
• Ambos são usados ​​no diagnóstico de doenças e na caracterização de doenças de um organismo.
• Ambas as áreas de estudo envolveram extração da biomolécula, separação da biomolécula e etapas de seqüenciamento.

Qual é a diferença entre proteômica e transcriptômica?

Protêmica vs Transcriptômica
A proteômica envolve o estudo completo de todas as proteínas em um organismo vivo.	Transcriptômica é o estudo completo de todas as moléculas de RNA mensageiro (mRNA) presentes em um organismo vivo.
Tipo de Bio Molécula Estudado
As proteínas são estudadas em proteômica.	RNAm são estudados em transcriptômica.
Fatores estudados
Estrutura, função, interações, modificações e aplicações das proteínas são estudadas em proteômica.	Estrutura sequencial, interações com o ambiente e aplicações do mRNA são estudadas em transcriptômica.

Resumo - Proteômica vs Transcriptomics 

O ômico desempenha um papel importante no campo das ciências da vida. Proteômica refere-se ao estudo do proteoma que forma as coleções completas de proteínas em uma célula ou organismo. Transcriptômica refere-se ao estudo do transcriptoma, que é o conjunto completo de DNA expresso que está na forma de mRNA. As duas áreas de estudo, proteômica e transcriptômica, foram derivadas após a introdução da genômica e atualmente são amplamente utilizadas em diagnósticos médicos e na caracterização e triagem de organismos. Essa é a diferença entre proteômica e transcriptômica.

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Referência:

1.Horgan, Richard P e Louise C Kenny. “Tecnologias 'Omic': genômica, transcriptômica, proteômica e metabolômica.” Obstetra e Ginecologista, Blackwell Publishing Inc, 18 de julho de 2011. Disponível aqui  
2.Graves, Paul R. e Timothy A.J. Haystead. "Guia do Biólogo Molecular para Proteômica." Revisões de Microbiologia e Biologia Molecular, Sociedade Americana de Microbiologia, março de 2002. Disponível aqui
3. Lowe, Rohan, et al. "Tecnologias de transcriptômica." Biologia Computacional PLoS, Biblioteca Pública de Ciências, maio de 2017. Disponível aqui  

Cortesia da imagem:

1.'Proteomics'By Xxl7441 em Wikibooks inglês - Transferido de en.wikibooks para Commons., (Domínio Público) via Commons Wikimedia
2.'Microarray e célula de fluxo de sequenciamento 'Por Thomas Shafee - Trabalho próprio, (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia