Diferença entre vetores de inserção e substituição

o diferença chave entre os vetores de inserção e substituição é que o vetor de inserção tem a capacidade de inserir comprimentos moderados de DNA estranho enquanto o vetor de substituição tem a capacidade de acomodar comprimentos maiores de DNA estranho.

Os vetores de fagos são os bacteriófagos utilizados para a clonagem. Existem dois tipos de vetores de fagos; eles são vetores de inserção e vetor de substituição. Além disso, todos os vetores de fagos consistem em genes não essenciais. No entanto, esses genes precisam ser removidos dos fagos para facilitar novas inserções de DNA estranhas.

CONTEÚDO

1. Visão geral e principais diferenças
2. O que são vetores de inserção
3. O que são vetores de substituição
4. Semelhanças entre vetores de inserção e substituição
5. Comparação lado a lado - vetores de inserção versus substituição em forma de tabela
6. Resumo

O que é um vetor de inserção?

Primeiro de tudo, o vetor de inserção é a forma mais simples de vetores de clonagem lambda. De fato, é um tipo de vetor de fago que possui um local de restrição único introduzido no genoma do vetor na posição do DNA opcional. Além disso, o DNA do fago permanece sem remoção. Esta não remoção do DNA do fago reduz o tamanho das inserções (DNA estranho) a serem clonadas no vetor. Além disso, estes vetores são úteis na clonagem e expressão de cDNA. GT10, GT11 e Zap são exemplos deste vetor.

Figura 01: Fago Lambda

O vetor de inserção consiste em um único site de reconhecimento. A função primária deste vetor é desenvolver bibliotecas de cDNA derivadas de sequências de mRNA eucarióticas. Além disso, ele só pode acomodar comprimentos de DNA estranho que variam entre 05-11 kb. Além disso, possui um local de clivagem exclusivo para a inserção de DNA estranho.

O que são vetores de substituição?

Vetor de substituição ou vetor de substituição é um tipo de vetor de fago desenvolvido a partir da remoção de uma região do meio 'fragmento de enchimento' do DNA do fago. A inserção de DNA estranho desejada substitui o DNA do fago.

Figura 02: Vetor de substituição

Os vetores de substituição são importantes na criação de bibliotecas genômicas, como EMBL4 e Charon40. Esses vetores podem acomodar um comprimento maior de DNA estranho, variando entre comprimentos de 08-24kb. A região de preenchimento também consiste em um gene que torna o vetor do fago inviável dentro de um hospedeiro bacteriano.

Quais são as semelhanças entre vetores de inserção e substituição?

• Os vetores de inserção e substituição são vetores de fagos.
• Ambos os vetores acomodam inserções de DNA estranhas.
• Ambos são úteis na criação de bibliotecas de DNA.

Qual é a diferença entre vetores de inserção e substituição?

Vetores de inserção vs substituição
O vetor de inserção é um tipo de vetor de fago que possui um local de restrição introduzido no genoma do fago no local do DNA opcional.	O vetor de substituição é um tipo de vetor de fago desenvolvido a partir da remoção de uma região do meio 'fragmento de preenchimento' do DNA do fago
Tamanho dos fragmentos de inserção
05-11 kb de comprimento	08-24 kb de comprimento
Fragmento de enchimento
Nenhum fragmento de preenchimento	O fragmento de preenchimento é substituído por uma inserção externa
Função
Importante para criar bibliotecas de cDNA	Importante na criação de bibliotecas de genoma
Exemplos
GT10, GT11 e Zap são exemplos	EMBL4 e Charon40 são exemplos
Site de clivagem
Um local de clivagem exclusivo está presente	O local da clivagem contém genes que não são essenciais para o ciclo lítico

Resumo - Inserção versus vetores de substituição

Os vetores de inserção e substituição são dois tipos de vetores fágicos. Ambos os vetores têm locais de restrição que facilitam a acomodação de novas inserções de DNA estranhas. Os vetores de inserção são importantes na criação de bibliotecas de cDNA, enquanto os vetores de substituição são importantes na criação de bibliotecas genômicas. Além disso, os vetores de inserção acomodam inserções de DNA com um comprimento moderado. Mas os vetores de substituição podem acomodar comprimentos mais altos de inserções de DNA estranhas. No geral, essa é a principal diferença entre os vetores de inserção e substituição.

Referência:

1. Hasty, P, et al. "A eficiência da inserção versus o direcionamento do vetor de substituição varia em diferentes locais cromossômicos." Biologia Molecular e Celular, U.S. National Library of Medicine, dezembro de 1994, disponível aqui.
2. "Vetores de inserção Lambda". Biologia 335 Notas de aula - Vetores Lambda, disponíveis aqui.
3. "Vetor de substituição". Vetor de substituição - Terminologia da biologia molecular para vetor de substituição - GenScript, disponível aqui.

Cortesia da imagem:

1. “Lambda phage” Por Lizanne Koch - trabalho próprio com ChemBioDraw (Domínio Público) via Commons Wikimedia