Diferença entre genotipagem e seqüenciamento

Diferença de chave - Genotipagem vs Seqüenciamento
 

A genotipagem e o seqüenciamento são duas técnicas realizadas para obter informações sobre os ácidos nucleicos, principalmente o DNA de um organismo. A principal diferença entre genotipagem e seqüenciamento é que genotipagem é o processo de determinar qual variante genética o indivíduo possui usando marcadores enquanto o sequenciamento é a determinação da ordem correta da sequência nucleotídica dentro do fragmento de DNA.

CONTEÚDO
1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é genotipagem
3. O que é sequenciamento
4. Comparação lado a lado - genotipagem vs seqüenciamento
5. Resumo

O que é genotipagem?

Genotipagem é a determinação da composição genética de um indivíduo usando uma sequência de DNA e marcadores e a comparação e identificação de sua herança. A genotipagem é importante na biologia evolutiva, biologia populacional, taxonomia, ecologia e genética dos organismos. Pode ser realizada por diferentes técnicas, incluindo sequenciamento de DNA, reação em cadeia da polimerase, polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP), detecção polimórfica amplificada aleatória, polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado (AFLP), microarranjos de DNA, etc..

A genotipagem envolve o seqüenciamento de pequenos fragmentos particulares de sequências de DNA e a descoberta da relação da composição genética com outros indivíduos usando marcadores genéticos. Determina os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) entre os indivíduos ou os alelos específicos. A genotipagem é aplicável a uma ampla gama de organismos, incluindo seres humanos. Também é aplicável a microorganismos como vírus, fungos etc. e pode ser usado para determinar suas variantes genéticas com os perfis de referência. Na epidemiologia molecular e na microbiologia forense, o controle de patógenos, especialmente microorganismos, é realizado pelas informações obtidas na genotipagem. A genotipagem é muito importante na análise de linhagem. Os seres humanos são genotipados para confirmar a maternidade e a paternidade. O genótipo revelará os alelos dominantes e recessivos dos genes que decidem características específicas.

Figura_1: Genotipagem RFLP

O que é Sequenciamento?

Sequenciar é o processo de determinar a ordem correta do nucleotídeo em um dado fragmento de DNA ou RNA. Praticamente todas as informações necessárias para o crescimento e desenvolvimento de um organismo são codificadas em seu genoma. A disponibilidade de técnicas para produzir e separar algumas centenas de fragmentos de ácidos nucleicos de nucleotídeos longos levou ao desenvolvimento de procedimentos para determinar a sequência exata de nucleotídeos de um dado fragmento de DNA ou RNA. Diferentes tipos de métodos de seqüenciamento estão disponíveis hoje. Esses métodos de seqüenciamento, juntamente com as tecnologias para construção de bibliotecas de genomas que representam todo o genoma de um organismo, facilitam o sequenciamento de todo o genoma desse organismo, fazendo uma análise aprofundada das estruturas, funções dos genes, localização dos genes, expressões genéticas, mapeamento de genes, regiões reguladoras de genes etc..

O genoma total de muitos vírus, várias bactérias, arqueobactérias, leveduras e vários outros organismos foi sequenciado e mapeado. O projeto do genoma humano tornou possível sequenciar e mapear todo o genoma humano e publicar seu primeiro rascunho em 2003. É um marco importante no avanço da biologia. Agora, as seqüências genômicas humanas são usadas no setor médico para identificar causas genéticas para doenças raras, rastrear o risco de doenças em recém-nascidos, identificar detalhes genéticos de diferentes tipos de câncer, desenvolver novas terapêuticas e desenvolver novas ferramentas de diagnóstico, etc..

No mundo das plantas, o genoma do arroz e o genoma de Arabidopsis foram seqüenciados. O conhecimento dessas seqüências revolucionará, sem dúvida, nosso entendimento de como as células e os organismos funcionam.

Figura_2: Uma autoradiografia do sequenciamento de sanger

Qual é a diferença entre Genotipagem e Seqüenciamento?

Genotipagem vs Sequenciamento
Genotipagem é o processo de determinar a composição genética de um indivíduo e verificar o grupo ou a taxonomia desse organismo.	Sequenciar é o processo de determinar a ordem precisa dos nucleotídeos de um dado fragmento de DNA ou RNA.
Técnicas
RFLP, seqüenciamento de genes, PCR, microarranjos de DNA, AFLP etc.	Sequenciação Sanger, Gilbert, Poseose, Next Generation Sequencing, Shotgun etc.
Principais Preocupações
Isso está mais preocupado se as diferenças de genótipo estão dando as diferenças reais de fenótipo.	Isso está mais preocupado com a ordem dos nucleotídeos e suas diferenças e alterações com outros organismos.

Resumo - Genotipagem vs Sequenciamento

A genotipagem e o seqüenciamento são úteis para o estudo da informação genética dos organismos. Genotipagem é o processo de determinar variações de genótipo entre indivíduos e encontrar suas categorias. Sequenciar é o processo de determinar a ordem correta dos nucleotídeos no fragmento interessado ou na região do DNA. Ambas as técnicas fornecem informações importantes sobre os genes e genomas.

Referência:
1. "Métodos de genotipagem". Métodos em biologia molecular (Clifton, N.J.). U.S. National Library of Medicine, n.d. Rede. 20 de fevereiro de 2017.
2. Akey, J.M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin e M. D. Shriver. "Análise de curva de derretimento de SNPs (McSNP ): uma abordagem sem gel e barata para a genotipagem de SNP". BioTechniques 30.2 (2001): 358-67. Rede.

Cortesia da imagem:
1. “Genotipagem RFLP” por (desconhecido) - Institutos Nacionais de Saúde (Domínio Público) via Commons Wikimedia
2. “Fluorescente radioativo” por Abizar na Wikipedia em inglês (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia