o diferença chave entre o DNA genômico e o isolamento do DNA do plasmídeo é que o o isolamento do DNA genômico visa a extração do DNA genômico, enquanto o isolamento do DNA plasmídico visa a extração do DNA plasmídico das bactérias.
O isolamento do DNA é um processo químico usado para isolar o DNA de diferentes espécies ou de diferentes amostras. O isolamento do DNA é importante nas técnicas de biologia molecular a jusante, como eletroforese em gel, reação em cadeia da polimerase e técnicas de sequenciamento de DNA. Portanto, o isolamento do DNA é um processo químico essencial em estudos biológicos moleculares. Com base no objetivo da pesquisa, às vezes é necessário isolar o DNA genômico. Além disso, alguns estudos se concentram no isolamento do DNA plasmidial de bactérias. O isolamento do DNA genômico é o processo de isolar o DNA genômico de uma amostra procariótica ou eucariótica. As etapas de isolamento diferem de acordo com o tipo de célula na qual o DNA está isolando. O isolamento do DNA do plasmídeo é o processo de isolar o DNA do plasmídeo a partir de uma célula bacteriana. Em comparação com o isolamento de DNA genômico, o processo geral é complexo no isolamento de DNA de plasmídeo.
1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é isolamento de DNA genômico
3. O que é isolamento de DNA de plasmídeo
4. Semelhanças entre o DNA genômico e o isolamento do DNA do plasmídeo
5. Comparação Lado a Lado - DNA Genômico vs Isolamento de DNA de Plasmídeo em Forma Tabular
6. Resumo
O isolamento do DNA genômico é o processo de extrair o DNA genômico inteiro de um organismo. Esse processo específico envolve três eventos principais. São eles: lise celular ou lise nuclear, degradação de proteínas ou proteólise e precipitação de DNA genômico. O passo da lise pode diferir de acordo com o tipo de célula. Nos procariontes, uma vez que existe uma parede celular peptidoglicana, o primeiro passo deve ser o colapso da parede celular. Por outro lado, em eucariotos, a etapa de lise envolve a quebra da membrana plasmática e da membrana nuclear para retirar o DNA para o exterior. Por outro lado, etapas especiais são essenciais para lisar as paredes celulares das plantas e dos fungos.
Figura 01: Isolamento genômico do DNA
Consequentemente, uma vez concluída a etapa de lise, eventualmente o DNA chegará ao sobrenadante. Simultaneamente, a degradação de proteínas também ocorre na solução devido à adição de proteinase K. O próximo passo é separar o DNA genômico e as proteínas degradadas. Portanto, as proteínas degradadas se separam por precipitação, permitindo que o DNA genômico permaneça no sobrenadante. Após a precipitação de proteínas, o DNA genômico pode ser precipitado e ressuspenso em um tampão adequado até que seja necessário para o experimento.
O DNA genômico, que é o DNA linear, contém todas as informações genéticas de um organismo. Em outras palavras, o genoma é o material de hereditariedade de um organismo vivo responsável por todas as atividades estruturais e funcionais da célula. Consiste em sequências de DNA codificantes e não codificantes. Ao isolar o DNA genômico, ele inclui todo o genoma do organismo.
O isolamento do DNA do plasmídeo é um processo especial e mais complicado de isolamento do DNA. Os plasmídeos são o DNA extracromossômico presente na maioria das células bacterianas. Eles são DNA circular adormecido que suporta a bactéria para sobreviver em condições ambientais adversas. O DNA do plasmídeo consiste em genes resistentes especiais que fornecem vantagens adicionais às bactérias, como resistência a antibióticos, propriedades de virulência e propriedades tóxicas.
Figura 02: Isolamento do DNA do plasmídeo
O isolamento do DNA do plasmídeo também envolve três processos principais; lise celular, proteólise e precipitação de DNA. Embora o mecanismo bioquímico de isolamento seja semelhante ao do isolamento do DNA genômico, o processo é mais complexo que ele. O processo de lise celular é o processo mais importante neste procedimento. Mais importante ainda, o DNA genômico e o DNA do plasmídeo não devem ser misturados. Portanto, um processo de lise muito mais suave é incorporado ao procedimento de isolamento do DNA do plasmídeo. Portanto, na maioria dos procedimentos de isolamento de DNA plasmídico, use o detergente; dodecilsulfato de sódio para a lise celular.
O isolamento do DNA genômico concentra-se na extração de DNA genômico inteiro do organismo alvo, enquanto o isolamento do DNA plasmídico se concentra no isolamento apenas do DNA plasmídico das espécies bacterianas específicas. Portanto, essa é a principal diferença entre o DNA genômico e o isolamento do DNA do plasmídeo. Além disso, outra diferença entre o DNA genômico e o isolamento do DNA do plasmídeo está no procedimento. O isolamento do DNA genômico é um procedimento menos complexo comparado ao isolamento do DNA do plasmídeo. Portanto, ao isolar o DNA plasmídico, é necessário tomar precauções para evitar a mistura de DNA genômico e plasmídico entre si..
A infografia abaixo fornece mais detalhes sobre a diferença entre o DNA genômico e o isolamento do DNA do plasmídeo.
O isolamento do DNA é um processo importante nas técnicas de biologia molecular. Existem dois tipos de DNA: DNA genômico e DNA plasmídico (DNA extra-cromossômico). Com base no requisito, alguns procedimentos foram realizados para isolar o DNA genômico, enquanto outros focam em isolar apenas o DNA do plasmídeo das bactérias. Portanto, as etapas envolvidas nos dois processos diferem um pouco da outra. No entanto, o processo geral é o mesmo nos dois isolamentos. O DNA isolado de ambos os processos tem imenso uso em processos a jusante, como clonagem, eletroforese em gel e reações em cadeia da polimerase. No final do protocolo de isolamento do DNA genômico, todo o DNA genômico do organismo pode ser isolado como o produto final, enquanto no final do protocolo de isolamento do DNA do plasmídeo, o DNA do plasmídeo da bactéria respectiva pode ser isolado como o produto final. Portanto, essa é a diferença entre o DNA genômico e o isolamento do DNA plasmídico.
1. "EXTRAÇÃO DE DNA DE BACTÉRIAS". Extração de DNA de bactérias. Disponivel aqui
1. ”DNA Extraction” Por Joo Nath - Trabalho próprio, (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. ”Plasmid miniprep” Por Retama - Trabalho próprio, (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia