A eletroforese em gel é uma técnica que separa macromoléculas em um campo elétrico. É um método comum na biologia molecular para separar DNA, RNA e proteínas das misturas de acordo com seus tamanhos moleculares. SDS Page é um tipo de eletroforese em gel usada para separar proteínas de uma mistura de proteínas com base em seus tamanhos. Eletroforese em gel é um termo usado para se referir à técnica normal aplicada à separação de DNA, RNA e proteínas enquanto SDS Page é um tipo de eletroforese em gel. Essa é a principal diferença entre eletroforese em gel e SDS Page.
CONTEÚDO
1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é eletroforese em gel
3. O que é a página SDS
4. Comparação lado a lado - eletroforese em gel versus página SDS
5. Resumo
A eletroforese em gel é uma técnica comum usada em laboratórios para separar moléculas carregadas, como DNA, RNA, proteínas, etc. de suas misturas. Um gel é usado na eletroforese em gel. Atua como uma peneira molecular. Existem dois tipos de géis usados na eletroforese em gel, a saber, agarose e poliacrilamida. A seleção de uma preparação de gel e gel é um fator importante a ser considerado nas eletroforeses de gel, uma vez que o tamanho dos poros do gel deve ser cuidadosamente manipulado para uma boa separação de moléculas por eletroforese em gel. A eletroforese em gel possui um campo elétrico conectado a duas extremidades do gel. Uma extremidade do gel mostra uma carga positiva enquanto a outra extremidade é carregada negativamente.
DNA e RNA são moléculas carregadas negativamente. Uma vez carregados no gel a partir da extremidade negativa do gel e aplicados ao campo elétrico, eles migram pelos poros do gel em direção à extremidade do gel com carga positiva. A velocidade da migração depende da carga e do tamanho da molécula. Moléculas menores migram facilmente através dos poros do gel do que moléculas maiores. Portanto, moléculas menores viajam uma longa distância através do gel e as moléculas maiores viajam uma curta distância. Para observar a viagem de moléculas no gel, tipos especiais de corantes são usados. O campo elétrico é aplicado por um certo período de tempo e parado para evitar a perda de moléculas e manter as moléculas em suas posições de deslocamento. Diferentes bandas podem ser observadas no gel. Essas bandas representam moléculas de tamanhos diferentes. Portanto, a eletroforese em gel é útil para diferenciar moléculas de acordo com seus tamanhos.
A eletroforese em gel é incorporada em várias técnicas como uma técnica preparatória em biologia molecular, como PCR, RFLP, clonagem, seqüenciamento de DNA, transferência de Southern, mapeamento de genoma, etc..
Figura 01: Eletroforese em gel de agarose
Eletroforese em gel de poliacrilamida com dodecilsulfato de sódio (Página SDS) é um tipo de eletroforese em gel usada para separar proteínas. Quando a eletroforese em gel é usada para separar proteínas, são necessários tratamentos especiais, pois as proteínas não são carregadas negativamente como DNA e RNA e não migram para o final positivo ou negativo. Portanto, as proteínas são desnaturadas e revestidas com uma carga negativa antes da eletroforese em gel. Isso é feito usando um detergente chamado dodecilsulfato de sódio (SDS). A eletroforese em gel que utiliza SDS e um gel de poliacrilamida para o meio de suporte é conhecida como SDS Page. Essa técnica é comumente usada em bioquímica, genética, forense e biologia molecular.
Durante a página SDS, as proteínas são misturadas com a SDS. O SDS desdobra as proteínas em uma forma linear e as reveste com uma carga negativa proporcional à sua massa molecular. Devido à carga negativa, as moléculas de proteína migram para a extremidade de carga positiva do gel e se separam de acordo com suas massas moleculares. Na página SDS, a poliacrilamida é usada como suporte sólido para o gel. A separação real das proteínas depende principalmente das propriedades do gel. Portanto, a preparação em gel de poliacrilamida deve ser feita com cuidado e as concentrações corretas de poliacrilamida devem ser usadas. Os géis de poliacrilamida apresentam alta resolução que os géis de agarose. Portanto, o SDS Page é considerado uma técnica de alta resolução para separação de proteínas.
SDS Page é um tipo de eletroforese em gel desnaturante. Tem uma grande limitação na análise de proteínas. Como a SDS desnatura proteínas antes da separação, ela não permite a detecção de atividade enzimática, interações de ligação de proteínas, cofatores de proteínas, etc..
Figura 02: página SDS
Eletroforese em Gel vs SDS Page | |
A eletroforese em gel é um método realizado para separar macromoléculas usando um campo elétrico. | SDS Page é uma técnica de eletroforese em gel de alta resolução usada para separar proteínas com base em sua massa. |
Gel Run | |
Pode ser realizado de maneira horizontal ou vertical. | A página SDS sempre é executada verticalmente. |
Base para Separação | |
A separação ocorre de acordo com a carga e o tamanho. | A separação de proteínas ocorre de acordo com a massa e a carga. |
Resolução | |
A eletroforese em gel de agarose tem baixa resolução e a eletroforese em gel de poliacrilamida tem uma resolução mais alta | A página SDS tem uma resolução melhor. |
Desnaturação | |
A eletroforese em gel inclui técnicas de desnaturação e não desnaturação. | Página SDS desnatura proteínas antes da separação. |
A eletroforese em gel é uma técnica comum usada para separação e análise de DNA, RNA e proteínas com base em seu tamanho e carga. Existem dois tipos principais de eletroforese em gel: eletroforese em gel de agarose e eletroforese em gel de poliacrilamida. Os géis de agarose são utilizados principalmente para a separação de ácidos nucleicos; quando é necessária uma resolução mais alta, são utilizados géis de poliacrilamida. SDS Page é um tipo de eletroforese em gel comumente usada para separar misturas complexas de proteínas. É considerada uma técnica de separação de proteínas de alta resolução. Essa é a diferença entre eletroforese em gel e SDS Page.
Referências:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig e David H. Petering. “SDS-PAGE nativo: separação eletroforética de proteínas de alta resolução com retenção de propriedades nativas, incluindo íons metálicos ligados. www.ncbi.nlm.nih.gov. N.p., maio de 2014. Web. 7 Abr. 2017
2. Stellwagen, Nancy C. "Eletroforese de DNA em géis de agarose, géis de poliacrilamida e em solução livre". Eletroforese. Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA, junho de 2009. Web. 07 Abr. 2017
Cortesia da imagem:
1. "Gelelektrophoreseapparatur" (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Eletroforese em gel de DNA Agarose" Pela Escola de Recursos Naturais de Ann Arbor - laboratório de DNA (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia