Diferença entre FISH e CGH

o diferença chave entre PEIXE e CGH é que FISH é uma técnica molecular que detecta uma sequência específica de DNA em um cromossomo usando sondas marcadas com fluorescência, enquanto CGH é outra técnica citogenética molecular que detecta alterações no DNA genômico.

A análise citogenética desempenha um papel importante na medicina ao detectar anormalidades cromossômicas, como aneuploidias, deleções, duplicações e rearranjos, etc. Anormalidades cromossômicas acabam por levar a doenças genéticas, como câncer, infertilidade, síndrome de Down, síndrome de Klinefelter, síndrome de Turner, leucemia etc. Existem vários métodos citogenéticos moleculares para detectar defeitos e doenças acima mencionados. Entre eles, FISH (hibridização fluorescente in situ) e CGH (hibridização genômica comparativa) são duas poderosas técnicas de hibridação. No entanto, ambos os métodos têm prós e contras.

CONTEÚDO

1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é PEIXE 
3. O que é CGH
4. Semelhanças entre peixes e CGH
5. Comparação lado a lado - FISH vs CGH em forma de tabela
6. Resumo

O que é peixe?

FISH é uma técnica de hibridação de ácido nucleico realizada em uma porção ou seção de tecido, em todo o tecido ou células. É um método baseado em análise. A técnica depende da teoria do emparelhamento de bases complementares do Watson Crick, resultando em híbridos de DNA - DNA ou híbridos de DNA - RNA, que podem detectar genes mutados ou identificar o gene de interesse. Além disso, esta técnica utiliza sequências de DNA de fita simples, sequências de DNA de fita dupla, sequências de RNA de fita simples ou oligonucleotídeo sintético preparado usando tradução de nick como sondas complementares às seqüências de genes de interesse. Além disso, a característica mais importante dessa técnica é a identificação de sondas com corantes fluorescentes. Assim, as sondas se ligam às partes complementares do cromossomo e facilitam a detecção.

Além disso, o FISH é um método altamente sensível e específico. Portanto, é uma técnica comum tanto na pesquisa quanto no diagnóstico de neoplasias hematológicas e tumores sólidos. Mas, o FISH mostra baixa resolução. Também requer conhecimento prévio da anormalidade alvo para projetar sequências de sondas.

Figura 01: PEIXES

Existem muitas aplicações do FISH, principalmente no diagnóstico molecular de doenças infecciosas para identificar a presença de patógenos e confirmar o patógeno por meio de diagnóstico molecular. Além disso, o FISH é uma técnica comumente usada nas áreas de biologia do desenvolvimento, cariotipagem e análise filogenética e mapeamento físico de cromossomos.

O que é CGH?

A hibridação genômica comparativa (CGH) é outra técnica citogenética molecular baseada em DNA que pode detectar as alterações nas seqüências de DNA genômico. O método é um método avançado que pode analisar modificações cromossômicas e genéticas para detectar alterações ou alterações nas sequências de DNA genômico. Além disso, o CGH requer o isolamento e a fragmentação do DNA da amostra experimental e da amostra de referência. Em seguida, as amostras devem ser rotuladas usando dois corantes fluorescentes diferentes (geralmente vermelho e verde). Mais tarde, ambas as amostras são misturadas e permitidas para hibridação competitiva. O passo final é a análise das amostras quanto a alterações no DNA, como duplicação de genes, perda de genes, etc. Especialmente, mede as diferenças no número de cópias de DNA entre a amostra de teste e a amostra de controle.

Figura 02: CGH

Outra versão do CGH está disponível agora; é um método mais avançado que o CGH normal. É uma técnica chamada CGH ou aCGH baseada em array. o aCGH permite a identificação precisa de deleções de genes ou sequências em muitos milhares de sequências em um único experimento.

Quais são as semelhanças entre FISH e CGH?

• FISH e CGH são duas técnicas moleculares.
• Tanto o FISH quanto o CGH dependem da hibridação de ácidos nucleicos.
• Além disso, ambas as técnicas precisam de sondas projetadas para detectar alvos de DNA específicos.
• Usamo-los para o diagnóstico pré-natal e pós-natal de doenças genéticas.
• Além disso, tanto o FISH quanto o CGH são ferramentas muito poderosas para estudar alterações genômicas.
• Eles usam corantes fluorescentes para rotular as sondas.

Qual é a diferença entre FISH e CGH?

PEIXE é um no local procedimento de hibridação que utiliza sondas fluorescentes para detectar seqüências específicas de DNA, enquanto o CGH é uma técnica de hibridação molecular que detecta as alterações das seqüências genômicas de DNA. Então, essa é a principal diferença entre FISH e CGH.

Além disso, o FISH requer conhecimento prévio da anormalidade alvo para projetar sequências de sondas, enquanto o CGH não requer conhecimento prévio. Além disso, outra diferença entre o FISH e o CGH é que o FISH mostra resolução limitada, enquanto o aCGH mostra alta resolução.

O infográfico abaixo resume a diferença entre FISH e CGH.

Resumo - FISH vs CGH

FISH e CGH são duas técnicas citogenéticas moleculares que facilitam a detecção de seqüências de genes de interesse. O FISH facilita a detecção de sequência específica de DNA em um cromossomo usando sondas marcadas com fluorescência, enquanto o CGH facilita a detecção de alterações no DNA genômico. Então, essa é a principal diferença entre FISH e CGH.

Referência:

1. “Hibridização por fluorescência in situ (FISH)” Nature News, Nature Publishing Group, disponível aqui.
2. Hester, Susan D, et al. "Comparação de tecnologias comparativas de hibridação genômica entre plataformas de microarrays". Jornal de Técnicas Biomoleculares: JBT, Associação de Instalações de Recursos Biomoleculares, abril de 2009, disponível aqui.

Cortesia da imagem:

1. “Ensaio Multiplex ViewRNA FISH em células Jurkat e HeLa” Por Ryan Jeffs - Trabalho próprio (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "CGH schema" Por Mbaudis () (Uploads) - Próprio trabalho (CC BY 2.5) via Commons Wikimedia