Diferença entre exoma e transcriptoma

Diferença de chave - Exome x Transcriptome
 

Um gene contém regiões codificantes e não codificantes dentro dele. As sequências de codificação são conhecidas como exons e as sequências não codificantes são conhecidas como íntrons. A sequência nucleotídica dos exons de um gene representa o código genético do gene para sintetizar a proteína específica. Portanto, os exons permanecem na molécula de mRNA. A região total do exon do genoma é conhecida como exoma e é uma parte importante do genoma. O código genético dos genes é convertido no código genético da molécula de mRNA, necessário para a produção de proteínas. Todas as moléculas de mRNA transcritas em uma célula ou em uma população celular de cada vez são conhecidas como transcriptoma. A principal diferença entre exoma e transcriptoma é que exoma representa as seqüências das regiões exônicas do genoma enquanto transcriptoma representa o RNAm total de uma célula ou tecido em um determinado momento.

CONTEÚDO
1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é Exome
3. O que é Transcriptome
4. Comparação lado a lado - Exome x Transcriptome
5. Resumo

O que é Exome?

Os genes são compostos de éxons, íntrons e sequências reguladoras. Éxons são as regiões gênicas que são transcritas na sequência de mRNA durante a transcrição. Os íntrons e outras regiões não codificantes são removidos durante a transcrição. A sequência nucleotídica dos exões determina o código genético do gene que sintetiza a proteína específica que codifica. Apenas exons permanecem no mRNA de uma proteína. A coleção de exons no genoma é conhecida como exoma de um organismo. Representa uma parte do genoma que é expressa em genes. Nos seres humanos, o exoma é responsável por 1% do genoma. É a porção codificadora de proteínas do genoma humano.

Figura 01: Exome

O que é Transcriptome?

O transcriptoma é a coleção de todos os transcritos de codificação e não codificação de proteínas (RNAs) em um determinado tecido. O transcriptoma representa a coleção de moléculas totais de mRNA expressas pelos genes em uma célula ou tecido. O transcriptoma de uma célula pode variar com o transcriptoma de outro tipo de célula. O transcriptoma também é dinâmico - muda com o tempo em resposta a estímulos internos e externos. Mesmo dentro do mesmo tecido ou do mesmo tipo de célula, o transcriptoma pode mudar após alguns minutos.

Transcriptome diferencia-se do exome de um organismo. O transcriptoma inclui apenas as sequências de exoma expressas. Embora o exoma de uma célula permaneça o mesmo, o transcriptoma difere entre as células, pois a expressão gênica não é a mesma para todas as células ou tecidos. Apenas genes essenciais são expressos em diferentes células e tecidos. A expressão gênica é um processo específico de tecido ou tipo de célula. É regulado por vários fatores, incluindo fatores ambientais. Portanto, o transcriptoma pode variar com as condições ambientais externas.

O transcriptoma é usado como precursor para estudos proteômicos. Todas as proteínas são derivadas de sequências de mRNA. Modificações na tradução podem resultar em alterações nas proteínas. Entretanto, o transcriptoma fornece informações básicas importantes para os estudos proteômicos.

Figura 02: Transcriptoma de células-tronco embrionárias

Qual é a diferença entre Exome e Transcriptome?

Exome vs Transcriptome
Exome é a coleção da região codificadora de proteínas dos genes.	Transcriptoma é a coleção de todo o RNA transcrito, incluindo o mRNA.
Amostra
Exome é estudado usando amostra de DNA.	O transcriptoma é estudado usando uma amostra de RNA.
Método de Estudo
O seqüenciamento completo do exoma é o método de estudo do exoma.	O sequenciamento de RNA é o método de estudar o transcriptoma.

Resumo - Exome x Transcriptome

Éxons são as seqüências codificadoras dos genes e determinam as seqüências de mRNA das proteínas. A coleção dessas seqüências de codificação (exons) é conhecida como exoma de um organismo. Os genes são transcritos em moléculas de mRNA antes da produção de proteínas. O total de moléculas de mRNA de uma célula ou tecido a qualquer momento é conhecido como transcriptoma. O transcriptoma representa os genes que estão sendo ativamente expressos no mRNA a qualquer momento. O transcriptoma é específico para células e tecidos e afeta as condições ambientais. Esta é a diferença entre exoma e transcriptoma.

Referências:
1.Sarah et al., “Captura direcionada e sequenciamento massivamente paralelo de doze exomas humanos”. Natureza. Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA, 10 de setembro de 2009. Web. 01 Abr. 2017
2.Mutz et al. "Análise de transcriptoma usando sequenciamento de próxima geração." Elsevier: Localizador de artigos. N.p., setembro de 2012. Web. 01 Abr. 2017

Cortesia da imagem:
1. ”O transcriptoma das células pluripotentes” Por Grskovic, M. e Ramalho-Santos, M., O transcriptoma pluripotente (10 de outubro de 2008), StemBook, ed. A Comunidade de Pesquisa em Células-Tronco, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Figura 2 O transcriptoma de células pluripotentes. Grskovic, M. e Ramalho-Santos, M., O transcriptoma pluripotente (10 de outubro de 2008), StemBook, ed. Comunidade de pesquisa em células-tronco, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, (CC BY 3.0) via Commons Wikimedia