Diferença entre cosmídeo e fagomídeo

o diferença chave entre Cosmid e Phagemid está no tipo de sequências que contém. Um cosmídeo contém um local cos e um plasmídeo. Portanto, é um vetor híbrido enquanto um fagomídeo é um plasmídeo que contém uma origem F1 de replicação do fago F1.

Cosmídeos e fagídeos são usados ​​para fins de clonagem, especialmente para clonar fragmentos maiores de DNA. Estes são amplamente utilizados, especialmente na clonagem de genes responsáveis ​​pela produção de várias proteínas. Os cosmídeos e os fagomóides são replicados sozinhos como plasmídeos ou são empacotados em partículas virais e depois replicados.

CONTEÚDO

1. Visão geral e principais diferenças
2. O que é um cosmídeo
3. O que é um Fagomídeo
4. Semelhanças entre Cosmídeo e Fagomídeo
5. Comparação lado a lado - Cosmid vs Phagemid em forma de tabela
6. Resumo

O que é um cosmídeo?

Um cosmídeo, referido como plasmídeo híbrido, compreende locais cos extraídos de partículas de fago Lambda e um plasmídeo. Esses locais cos são longos fragmentos de DNA com 200 pares de bases. Portanto, eles têm extremidades coesas ou pegajosas que permitem que o plasmídeo se encaixe no DNA viral. Portanto, os locais cos são vitais para a embalagem do DNA.

Existem três sites de cos;

  • local cosN - envolvido no corte da fita de DNA pela atividade da terminase
  • site cosB - envolvido na realização da terminase.
  • local cosQ - envolvido na prevenção da degradação do DNA pelas DNases.

Figura 01: Cosmídeo

Além disso, os Cosmids podem replicar o DNA de fita simples ou o DNA de fita dupla usando uma origem de replicação adequada. Cosmídeos geralmente contêm genes de resistência a antibióticos como marcadores para seleção de transformantes. Assim, o uso de um cosmídeo como vetor pode facilitar a clonagem e a digestão com enzimas de restrição do vetor pode extrair esses fragmentos..

O que é um Fagomídeo (Phasmid)?

Phagemid, também denominado como Phasmid, também é um tipo de vetor híbrido. O fagomídeo contém uma origem especial de replicação denominada origem f1 da replicação. A origem f1 da replicação extrai de um fago f1.

O fagomídeo pode replicar o DNA de fita simples e dupla. A replicação pode ocorrer como um plasmídeo enquanto se submete à replicação independente ou pode ser empacotada em partículas de fago e finalmente infectar o hospedeiro bacteriano E coli. Ao infectar o E coli células, o fago f1 requer a presença de um pilus. Portanto, os pilotos sexuais são importantes durante em vitro embalagem de fagomóides.

Quais são as semelhanças entre Cosmid e Phagemid?

  • Cosmid e Phagemid são vetores de clonagem usados ​​na tecnologia de DNA recombinante.
  • Cosmid e Phagemid podem replicar DNA de fita simples e dupla.
  • Ambos podem sofrer replicação independente semelhante aos plasmídeos.
  • Cosmid e Phagemid podem sofrer em vitro empacotar e infectar células bacterianas.
  • Cosmid e Phagemid requerem uma origem de replicação adequada para clonagem.

Qual é a diferença entre Cosmid e Phagemid?

Cosmid vs Phagemid

Cosmid é um vetor híbrido que contém um site cos e um plasmídeo. O fagomídeo é um plasmídeo que contém uma origem F1 de replicação do fago F1.
 Presença de sites Cos
Os locais Cos estão presentes no cosmídeo e são necessários para embalagens in vitro. Os sites Cos estão ausentes no fagomídeo.
 Presença de origem de replicação F1
No cosmídeo, a origem fi da replicação pode ou não apresentar. A origem da replicação F1 está presente no fagomídeo.
Presença de genes resistentes a antibióticos
Genes resistentes a antibióticos estão presentes em cosmídeos para identificar os transformantes de não transformantes. Genes resistentes a antibióticos estão ausentes em fagóides.
Exigência de Embalagem In Vitro
Requer um site cos. Requer pilus sexual.

Sumário - Cosmid vs Phagemid

Cosmid e Phagemid são vetores de clonagem usados ​​na tecnologia de DNA recombinante. Cosmídeos são vetores híbridos que contêm extremidades adesivas especiais conhecidas como locais cos. em vitro embalagens exigem esses locais de cos. Enquanto os fagóides são plasmídeos que contêm uma origem de replicação f1 extraída do fago f1. Tanto o cosmídeo quanto o fagomídeo podem sofrer replicação independente ou em vitro embalagem para células bacterianas. Estas são as diferenças importantes entre cosmídeo e fagomídeo.

Referência:

1.Qi, H, et al. "Vetores fagomóides para exibição de fagos: propriedades, características e construção". Journal of Molecular Biology., Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA, 30 de março de 2012. Disponível aqui 
2. Collins, J e B Hohn. "Cosmídeos: um tipo de vetor de clonagem de gene de plasmídeo que é empacotável in vitro em cabeças lambda de bacteriófagos". Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América, Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA, setembro de 1978. Disponível aqui  

Cortesia da imagem:

1. 'Cosmid (Inglês)' Por Zlir'a (CC0) via Commons Wikimedia