A enorme controvérsia sobre o site Wikileaks e a proximidade de seu nome à Wikipedia levaram muitos a questionar qual é a conexão entre esses dois sites. A resposta curta para a pergunta é nada. O Wikileaks não está de forma alguma conectado à Wikipedia ou à Wikimedia. Diferente da Wikipedia, que é uma enciclopédia on-line criada por usuários, o Wikileaks é um site dedicado a expor informações que de outra forma não estariam disponíveis para o público em geral. O objetivo do Wikileaks é expor os males da sociedade, como corrupção e crime, e revelar a verdade sobre o que realmente aconteceu em certos eventos..
O conteúdo da Wikipedia é principalmente factual e já está disponível de uma maneira ou de outra. Isso pode variar de fatos científicos básicos, eventos históricos, cultura popular e muito mais. Por outro lado, o conteúdo do Wikileaks são na maior parte documentos confidenciais e comunicações de governos e organizações que detalham suas atividades menos que admiráveis. Mais notavelmente, o Wikileaks divulgou centenas de milhares de documentos sobre gerenciamento e atividades dos EUA nas guerras no Oriente Médio. Alguns afirmam que esta informação pode ser prejudicial para a vida das tropas que são enviadas para lá.
Outro ponto de diferença entre os dois sites é a legalidade de suas atividades. As operações da Wikipedia estão em conformidade com as leis e qualquer material considerado com direitos autorais é removido imediatamente para evitar violações. A natureza dos arquivos apresentados pelo Wikileaks significa que a legalidade de sua operação é bastante questionável, pois eles não são adquiridos por meios legais. Por causa disso, o Wikileaks enfrentou grande escrutínio por agências de leis nos EUA. Outras empresas também se recusaram a continuar negociando com o Wikileaks, com medo de serem consideradas cúmplices de qualquer coisa que o Wikileaks esteja cometendo; o último dos quais é o processador de pagamento Paypal.
Em termos de como o site interage com os usuários, também houve algumas mudanças importantes. O Wikileaks começou como uma Wiki editável pelo usuário, assim como a Wikipedia. Devido aos tópicos controversos e ao desejo de outras pessoas de tirar essas informações da Internet, o Wikileaks decidiu retornar a um estilo de publicação mais convencional, no qual as informações enviadas pelo usuário vão para a equipe do Wikileaks e determinam se vale a pena publicar as informações ou não.
Resumo: